Håkan är verksam som professor i idrottspedagogik vid Gymnastik- och idrottshögskolan, GIH. Där leder han forskningsgruppen för pedagogisk idrottsforskning, där pedagogiska frågor relaterade till idrott i skolan och på fritiden står i fokus. Håkan bedriver forskning med två huvudinriktningar, den ena om didaktiska frågor inom skolämnet idrott och hälsa, den andra om idrottspedagogiska frågor relaterade till kropp och genus. Ibland går dessa forskningsområden samman. År 2016 kom Håkan med boken Idrott och hälsa – i går, i dag, i morgon (Liber förlag) i vilken han samlar sina kunskaper och erfarenheter om undervisning och lärande i idrott och hälsa efter 15 års forskning.